El volcán contiene varios domos volcánicos producto de sus erupciones en tiempos holocénicos. Estos son la Viudita, la Viudita Chica, Omoturco y el Arenal. Excepto el domo del Arenal, todos se formaron al exterior de la caldera del Ninahuilca, donde también existe una pequeña laguna.

         Ninahuilca creció sobre la caldera derruida del Atacazo.

         Los depósitos del volcán consisten en plagioclasa, hornblenda, hipersteno, cuarzo, magnetita y trazas de biotita y augita. No se detectan señales de actividad fumarólica o termal, aunque podría haber movimiento sísmico.

         Este volcán suele generar flujos piroclásticos y deslizamiento de escombros, producto del crecimiento y colapso de domos. Al parecer, su última erupción data de hace 2.350 años.